Dans un communiqué de presse, Laurent Croizier, le Président du Modem du Doubs, réagit à la répartition des services de l’état et autres institutions et organismes entre la Bourgogne et la Franche-Comté. Une nouvelle polémique est née après le choix de Marie Guite Dufay d’installer à Dijon la direction de l'enseignement supérieur, de la recherche et celle de l'environnement.
Pour Laurent Croizier, « le siège bisontin de la région ne devrait être qu'un placard, qui ne disposera que d’un bureau et d’une boîte à lettres, à bonne distance de Dijon ». Et de poursuivre : « Il apparaît, décisions après décisions, que Mme Dufay a troqué son poste de présidente de région, acceptant d'être sous la tutelle de son 1er vice-président, secrétaire de la fédération PS de Bourgogne, qui tire toutes les ficelles ».